Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sp4Q62445 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sp4Q62445 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sp4Q62445 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sp4Q62445 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sp4Q62445 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sp4Q62445 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sp4Q62445 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sp4Q62445 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sp4Q62445 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms