Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nptx1Q62443 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nptx1Q62443 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nptx1Q62443 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nptx1Q62443 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nptx1Q62443 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nptx1Q62443 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nptx1Q62443 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nptx1Q62443 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nptx1Q62443 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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