Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa13Q62424 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa13Q62424 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms