Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Sycp1Q62209 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms