Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rbm38Q62176 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rbm38Q62176 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbm38Q62176 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbm38Q62176 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbm38Q62176 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbm38Q62176 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbm38Q62176 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbm38Q62176 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbm38Q62176 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rbm38Q62176 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rbm38Q62176 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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