Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SspnQ62147 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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