Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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