Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcd1Q61466 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms