Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms