Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms