Protein–RNA interactions for Protein: Q61006

Musk, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 868 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MuskQ61006 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MuskQ61006 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MuskQ61006 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MuskQ61006 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MuskQ61006 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MuskQ61006 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MuskQ61006 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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MuskQ61006 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MuskQ61006 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MuskQ61006 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MuskQ61006 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MuskQ61006 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MuskQ61006 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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MuskQ61006 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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MuskQ61006 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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MuskQ61006 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MuskQ61006 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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MuskQ61006 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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MuskQ61006 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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MuskQ61006 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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MuskQ61006 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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MuskQ61006 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MuskQ61006 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms