Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms