Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ripk1Q60855 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ripk1Q60855 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ripk1Q60855 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ripk1Q60855 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ripk1Q60855 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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