Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atf3Q60765 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms