Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcf4Q60722 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms