Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HnrnpdQ60668 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms