Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms