Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms