Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms