Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psme4Q5SSW2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms