Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms