Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc85aQ5SP85 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85aQ5SP85 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms