Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms