Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim41Q5NCC3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim41Q5NCC3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms