Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
1810065E05RikQ5NC41 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms