Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttf2Q5NC05 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms