Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clhc1Q5M6W3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms