Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rtl5Q5DTT4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtl5Q5DTT4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms