Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chsy3Q5DTK1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms