Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2f8Q58FA4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2f8Q58FA4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms