Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf354cQ571J5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf354cQ571J5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms