Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn2bQ56A07 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn2bQ56A07 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn2bQ56A07 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn2bQ56A07 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn2bQ56A07 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn2bQ56A07 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn2bQ56A07 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms