Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prune2Q52KR3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prune2Q52KR3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms