Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms