Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms