Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc84Q4VA36 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms