Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox3aQ4TU90 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms