Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL66

Psg28, Pregnancy-specific glycoprotein 28, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psg28Q4KL66 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psg28Q4KL66 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms