Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms