Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Snx25Q3ZT31 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Snx25Q3ZT31 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Snx25Q3ZT31 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Snx25Q3ZT31 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Snx25Q3ZT31 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Snx25Q3ZT31 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snx25Q3ZT31 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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