Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G4

BC030870, cDNA sequence BC030870, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030870Q3V2G4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BC030870Q3V2G4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC030870Q3V2G4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC030870Q3V2G4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC030870Q3V2G4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC030870Q3V2G4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC030870Q3V2G4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC030870Q3V2G4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BC030870Q3V2G4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms