Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc110Q3V125 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms