Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc114Q3UX62 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc114Q3UX62 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms