Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capn13Q3UW68 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms