Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm27235Q3UW50 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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