Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdc42bpaQ3UU96 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc42bpaQ3UU96 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms