Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Obox3Q3UT54 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox3Q3UT54 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms