Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TceancQ3US16 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms