Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp560Q3URI6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp560Q3URI6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms