Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdgfl2Q3UMU9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms